bwSelect терпит неудачу в e lnet с 'y является постоянным' - PullRequest
Новая
       80

bwSelect терпит неудачу в e lnet с 'y является постоянным'

0 голосов
/ 28 апреля 2020

Запуск следующего сценария в R для запуска выбора полосы пропускания для набора данных настроения: 

library(mgm)
bwSeq <- seq(0.01, 1, length = 10)
set.seed(1)

bw_object <- bwSelect(data = mood_data, 
    type = rep("g", 6), level = rep(1, 6), bwSeq = bwSeq
    bwFolds = 1, bwFoldsize = 10, modeltype = "mvar", lags = 1, 
    scale = TRUE, timepoints = time_data$time_norm, 
    beepvar = time_data$beepno, dayvar = time_data$dayno, pbar = TRUE)

Все переменные имеют стандартные отклонения больше 0, но я получаю следующее сообщение об ошибке при запуске скрипт:

Error in elnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, type.gaussian, : y is constant; gaussian glmnet fails at standardization step

1 Ответ

0 голосов
/ 01 мая 2020 
> dput(mood_data[1:20,])

структура (c (0,035978818, -0,811345115, -0,477971764, -0,04736452, -1,505872928, 1,508377782, -1,214171246, -0,26961342, 2,63351284, -0,922469565, 0,4660686 067,60 066,662,66,60,60,60,60,663,263,268,268). 0,466586062, 1,716736126, 0,952755532, 0,7721783, 0,813849969, 3,314150097, 0,268157106, 3,94177421, 4,59312476, 4,59312476, -0,057518169, 4,59312476, 0,854372602, 1,010696734, 0,176968029, -0,474382521, 0,698048469, -0,265950345, 0,072751941, -0,865192851, 0,841345591, 0,385400205, 0,737129502, -0,344112411, -0,422274477, -0,513463554, -0,428933527, 1,764971218, 2,177846281, 2,841684617, -0,258926148, 2,266897765, 1,813544755, 1,222566724, -0,024154054, -1,125154221, 0,607301925, 0,558728388, 1,659728555, 1,263044671, 0,696353409, -0,129396717, 1,230662313, -0,428933527 , -0,22654379, -0,323690864, ​​-0,677372622, 2,457906979, 2,689198097, -0,368984464, -0,677372622, 0,453383955, 0,32488889, -0,150542853, -0,677372622, -0,677372622, -0,677372622, -0,677372622, 0,491932475, -0,009198281, -0,677372622, -0,343285451, 0,633277047, -0,677372622, -0,201940879, -0,677372622, 2,240035278, 0,903458603, 0,790735269, 1,49928194, -0,465324739, 2,57820528, 2,900271949, -0,030534736, 0,162705265, -0,497531406, 0,259325266, -0,529738072, -0,207671404 , 0,178808599, -0,449221405, 1,03228527, 2,497688613, 0,613598601, 1,49928194, 3,061305283, 0,514452286, 1,873152386, 2,158041117, 2,158041117, 0,591153098, 2,158041117, 2,158041117, 1,752622539, -0,690846191, -0,690846191, 0,536366803, -0,296384871, 0,941785382, 1,489648326, 0,9636999, 0,109033707 , 1.796451574, 0.503495027, 0.196691778, -0.033410658), .Dim = c (20L, 6L), .Dimnames = list (NULL, c ("hyp", "In", "Avoid", "Dep", "стресс", "ICS")))

...