Я не уверен, что именно вы хотите получить в качестве выходных данных (вы упомянули set, но я не буду хранить координаты в set, потому что lat и long могут быть перепутаны, и вы, вероятно, захотите убедиться, что знаете, какое число что. Если вы хотите узнать больше о наборах, вы можете прочитать https://realpython.com/python-sets), поэтому я сделал две версии примера.
Если вы хотите просто отдельные строки, такие как "20.23425,14.14145", тогда :
for long, lat in zip(enugu.geometry.x, enugu.geometry.y):
coords = str(long) + ", " + str(lat)
#You can do something with your coords then..
Если вы хотите список кортежей, то:
coords = []
for long, lat in zip(enugu.geometry.x, enugu.geometry.y):
coords.append((long, lat))
Результат этого будет таким: [(12.2134, 12.1452), (34.2524, 21.1201),. ..]
Вы можете легко адаптировать этот код к любой структуре данных, которая вам может понадобиться, например, 2d numpy arrays et c