Как интерпретировать вложенную перекрестную проверку для набора данных радужной оболочки? - PullRequest
0 голосов
/ 28 апреля 2020

Я хотел лучше понять проверку с помощью вложенного креста. Я посмотрел на пример, представленный в Sci-Kit Learn, в котором сравниваются не вложенные и вложенные стратегии перекрестной проверки на классификаторе набора данных радужной оболочки.

Я не совсем понял, в чем разница между вложенными и здесь не вложенная перекрестная проверка и каково преимущество использования одного над другим.

Означает ли вложенное, что вы не оптимизировали гиперпараметры с помощью перекрестной проверки, а с помощью простого поезда. разделение проверки? Или это означает, что вы оценивали точность тестов не по разным перекрестным проверкам, а по простому разделению проверочных испытаний? Используя этот подход, я наблюдал более высокую точность в не вложенной перекрестной проверке. Почему это так? Разве у вложенной перекрестной проверки не должно быть лучшей основы для оценки обобщения для набора тестов или лучшего выбора гиперпараметров? Разве лучшая производительность для не вложенных просто не будет отражать удачную разбивку по валидации или проверке?

from sklearn.datasets import load_iris
from matplotlib import pyplot as plt
from sklearn.svm import SVC
from sklearn.model_selection import GridSearchCV, cross_val_score, KFold
import numpy as np

print(__doc__)

# Number of random trials
NUM_TRIALS = 30

# Load the dataset
iris = load_iris()
X_iris = iris.data
y_iris = iris.target

# Set up possible values of parameters to optimize over
p_grid = {"C": [1, 10, 100],
          "gamma": [.01, .1]}

# We will use a Support Vector Classifier with "rbf" kernel
svm = SVC(kernel="rbf")

# Arrays to store scores
non_nested_scores = np.zeros(NUM_TRIALS)
nested_scores = np.zeros(NUM_TRIALS)

# Loop for each trial
for i in range(NUM_TRIALS):

    # Choose cross-validation techniques for the inner and outer loops,
    # independently of the dataset.
    # E.g "GroupKFold", "LeaveOneOut", "LeaveOneGroupOut", etc.
    inner_cv = KFold(n_splits=4, shuffle=True, random_state=i)
    outer_cv = KFold(n_splits=4, shuffle=True, random_state=i)

    # Non_nested parameter search and scoring
    clf = GridSearchCV(estimator=svm, param_grid=p_grid, cv=inner_cv)
    clf.fit(X_iris, y_iris)
    non_nested_scores[i] = clf.best_score_

    # Nested CV with parameter optimization
    nested_score = cross_val_score(clf, X=X_iris, y=y_iris, cv=outer_cv)
    nested_scores[i] = nested_score.mean()

score_difference = non_nested_scores - nested_scores

print("Average difference of {:6f} with std. dev. of {:6f}."
      .format(score_difference.mean(), score_difference.std()))

# Plot scores on each trial for nested and non-nested CV
plt.figure()
plt.subplot(211)
non_nested_scores_line, = plt.plot(non_nested_scores, color='r')
nested_line, = plt.plot(nested_scores, color='b')
plt.ylabel("score", fontsize="14")
plt.legend([non_nested_scores_line, nested_line],
           ["Non-Nested CV", "Nested CV"],
           bbox_to_anchor=(0, .4, .5, 0))
plt.title("Non-Nested and Nested Cross Validation on Iris Dataset",
          x=.5, y=1.1, fontsize="15")

# Plot bar chart of the difference.
plt.subplot(212)
difference_plot = plt.bar(range(NUM_TRIALS), score_difference)
plt.xlabel("Individual Trial #")
plt.legend([difference_plot],
           ["Non-Nested CV - Nested CV Score"],
           bbox_to_anchor=(0, 1, .8, 0))
plt.ylabel("score difference", fontsize="14")

plt.show()
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...