Я использую DESeq с tximport,
rownames(samples) <- colnames(txi$counts)
Командная строка выдает ошибку:
Error in `.rowNamesDF<-`(x, value = value) : invalid 'row.names' length
Я проверил:
> rownames(samples)
[1] "1" "2" "3" "4" "5" "6" "7" "8" "9" "10"
> colnames(txi$counts)
[1] "17_quant" "18_quant" "19_quant"
[4] "20_quant" "21_quant"
Я попытался сбросить автоматическая нумерация c для первого столбца для samples, поскольку соответствующие имена образцов находятся во втором столбце, но это не сработало. Кроме того, имена в файле samples, соответствующие каждому образцу, не имеют суффикса _quant. Спасибо за вашу помощь!