Ну, вы можете использовать опцию ниже, чтобы очистить элементы, которые уже присутствуют.
driver.find_element_by_xpath("//a[@class='search-choice-close']").click()
, если вы хотите закрыть все уже выбранные элементы, используйте find_elements
и повторите.