Запуск Conda на удаленном кластере - PullRequest
Новая
       19

Запуск Conda на удаленном кластере

0 голосов
/ 29 апреля 2020

Я пытаюсь установить Anaconda на удаленный кластер. Я установил Anaconda 3 и обновленную версию python. Я добавил следующее в мой .bash_profile 

    #python 3
    export PATH="$HOME/.local/bin:$PATH"
    #Anaconda
    export PATH=/usr/local/anaconda3/bin:$PATH

Я сохранил этот документ .txt и запустил: 

    source ~/.bash_profile

Я вышел из кластера, затем s sh ' обратно. Когда я запускаю 

    conda --v

я получаю следующую ошибку:

conda: команда не найдена

Как это исправить? Любая помощь с благодарностью!

Примечание. Я устанавливаю anaconda для загрузки в пакет MAGeCK для анализа RNAseq. Я знаю, что все, что мне нужно, это Miniconda, но я подумал, что не повредит иметь дополнительные инструменты анализа для последующих приложений.

...