Я действительно ошибался. Я думал, что именем ветви по умолчанию ("deploy") была ветка, которая была извлечена из удаленного хранилища. Фактически, извлеченная ветвь является основной ветвью репозитория GitHub.
Последние изменения, которые появились на моем сервере после того, как я слил их с главной ветвью в удаленном репозитории.