Это правда, что и Firefox, и gtkmozembed используют движок рендеринга Gecko, но версии движков, в которых вы пробуете свой код, могут отличаться, так что функция может быть или не быть доступной.
Стоит отметить, что вряд ли нужно использовать эту функцию в реальности - вы можете подойти к проблеме с другой стороны - проверьте свойство event.target, чтобы увидеть, откуда произошло ваше событие мыши.
Кстати: функция document.elementFromPoint - еще один пример великолепной, но запатентованной технологии, созданной в Internet Explorer. Как и многие другие полезные функции, он был приобретен совсем недавно и реализован многими поставщиками, включая Mozilla.