Нет, я бы подумал, что это небезопасно их комментировать. Если вы закомментируете их, в вашем коде будут некоторые функции, которые не определены, и ваша программа не будет компилироваться. Если бы вы написали программу, я бы порекомендовал поискать некоторые библиотеки, которые вы можете использовать в unix системах. Как ncurses вместо Conio.