чтобы настроить atom, чтобы он стал python, вам нужны такие пакеты, как:
Community Packages (14) /home/simone/.atom/packages
├── Hydrogen@2.14.1
├── atom-ide-ui@0.13.0
├── autocomplete-python@1.16.0
├── hydrogen-python@0.0.8
├── ide-python@1.5.0
├── intentions@1.1.5
├── linter@2.3.1 (disabled)
├── linter-flake8@2.4.0
├── linter-ui-default@1.8.1
└── python-autopep8@0.1.3
, а для запуска atom в среде conda / pyenv вам просто нужно:
$ cd [path to project]
$ conda activate [env]
$ atom .
, чтобы Atom использовал python env для запуска сценариев.