Ваш селектор
$( "input:checked" )
выбирает массив всех входных элементов, которые проверяются. Затем, пытаясь получить значение этого выбора с помощью
$( "input:checked" ).val()
, вы всегда получаете значение первого элемента в этом массиве.
Если вы хотите чтобы вывести значение всех проверенных элементов, вам нужно перебрать по этому массиву и собрать все значения:
$( "input" ).on( "click", function() {
let checkedValues = $( "input:checked" ).map(function() {
return $(this).val();
}).get().join(', ');
alert('Checked: ' + checkedValues );
});
<link href="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.7/css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet"/>
<script src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/jquery/3.3.1/jquery.min.js"></script>
<div class="options-check">
<div class="row">
<div class="col-sm-4 col-lg-4">
<div class="form-check form-check-inline">
<input class="form-check-input" type="checkbox" id="inlineCheckbox1" name="abc" value="all">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox1">All</label>
</div>
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox2" name="abc" value="businessrules">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox2">Business Rules</label>
</div>
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox3" name="abc" value="scriptinclude">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox3">Script Include</label>
</div>
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox4" name="abc" value="schedulejobs">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox4">Scheduled Jobs</label>
</div>
</div>
<div class="col-sm-4 col-lg-4">
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox5" name="abc" value="uiaction">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox5">UI Action</label>
</div>
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox6" name="abc" value="uipolicies">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox6">UI Policies</label>
</div>
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox7" name="abc" value="uimacro">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox7">UI Macro</label>
</div>
<div class="form-check form-check-inline">
<input type="checkbox" id="inlineCheckbox8" name="abc" value="uipage">
<label class="form-check-label" for="inlineCheckbox8">UI Page</label>
</div>
</div>
</div>
</div>