Я не смотрел на это / конкретно /, но это потенциально то, с чем может помочь дополнительная оснастка.
Если вы работаете как с Java, так и с .NET, тогда это более важный вопрос, чем просто protobuf-net; Вы должны быть в состоянии использовать его как конец Java, а также. protobuf (проводной формат) является кроссплатформенным, а protobuf-net является лишь одной конкретной реализацией.
Если предпочитаемый вами REST API обеспечивает эффективную обработку byte[] (в виде строки base-64 в сообщении или в виде необработанного ответа), вы можете просто обработать его как двоичный файл.
Если вы можете указать мне на инструмент, который вы хотите использовать, я могу взглянуть, но я не могу гарантировать что-либо немедленное.