только что нашел как это сделать.
1) Получите значение 'item_id' для элемента приложения, к которому вы хотите привязать родительское приложение.
$item_id = $item->item_id;
2) Используйте item_id в поле отношения дочернего приложения.
new PodioAppItemField(array("external_id" => "my_rel_field", "values" => array( 'item_id' => $item_id)))