Я пытаюсь назначить переменные файлам с несколькими расширениями и именем тела.
. Здесь я застрял
переменной f требуется только базовое имя для команды (извлечено из родительского файла xyz .fasta)
f2 - это файл с шаблоном B_C_R1_001.fastq
f3 - это файл с шаблоном B_C_R2_001.fastq
for f in */sequences/*.fasta
do
basename=${f%.fasta}
f2=?
f3=?
command -a -b $basename -i $f2 -I $f3
done'
Я пытаюсь установить переменную задания для f2 и f3
спасибо