Я хочу сделать анализ QTL. В первом скрипте: read.cross
У меня проблема. Суффикс данных моего генотипа "csvs"
, но для данных фенотипа "csv"
. Другое дело, что в данных генотипа sep=";" dec=","
, но в данных фенотипа sep="," dec=". "
я использую этот скрипт:
options(contrasts=c("contr.sum", "contr.poly"))
trellis.device(device = postscript,color = T)
QTL_LR4_cadmium_root_length<-read.cross("csvs", genfile="R44_CM_2007_geno.csvs",
phefile="Phenotype_root _length.csv",
na.strings = TRUE, sep=";", dec=",")
, и я получил эту ошибку:
Ошибка в read.cross.csvs (dir, genfile, phefile, na.strings, genotypes,: не удается найти отдельный столбец идентификатора (ожидаемый 'ID') в файле фенотипа. **
Я не знаю, эта ошибка из-за различий в сентябре и де c в genfile и phefile или из-за различий в суффиксах csvs
и CSV
или для обоих.
Что мне делать?