Для управления удаленными файлами через соединение S SH не используйте команды оболочки, используйте стандартный API управления файлами S SH, SFTP .
ssh = paramiko.SSHClient()
# ...
ssh.connect(...)
sftp = ssh.open_sftp()
with sftp.open("/remote/path/my.log", "r") as f:
for line in f:
# process the line as you need
print(line.rstrip())