Если у меня есть эта переменная в bash:
sample='sampleA' export $sample
Как я могу использовать ее в R?
read.table('/home/"$sample"/file.txt')
Я не нахожу модуль, похожий на os в python.
os
Ваш случай:
sample = Sys.getenv(c("sample"))
Использование: Sys.getenv (c ("VAR1", "VAR2", "VAR3", ..., "VARN"))