Я думаю, что нет способа восстановить неотмеченные измененные файлы.
Хотя вы, возможно, захотите посмотреть историю и отмену файлов вашего текстового редактора. Я не раз восстанавливал удаленные файлы оттуда.
Чтобы отменить конфликтующее слияние, безопаснее сделать git merge --abort
.