Отсутствующие зависимости rtree

Question

В настоящее время я использую Spyder для Python, и у меня появляется следующее сообщение об ошибке при открытии программы: Ошибка: у вас отсутствуют зависимости!

rtree> = 0.8.3: Нет (NOK)

Пожалуйста, установите их, чтобы избежать этого сообщения.

Примечание: Spyder может работать без некоторых из этих зависимостей, однако, чтобы иметь гладкую работу, мы настоятельно рекомендуем.

Я попробовал pip установите rtree и получите:

Collecting rtree
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/11/1d/42d6904a436076df813d1df632575529991005b33aa82f169f01750e39e4/Rtree-0.9.3.tar.gz (520kB)
     |████████████████████████████████| 522kB 467kB/s
    ERROR: Command errored out with exit status 1:
     command: 'C:\Users\gitte\Anaconda3\python.exe' -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'C:\\Users\\gitte\\AppData\\Local\\Temp\\pip-install-kmbt5h2t\\rtree\\setup.py'"'"'; __file__='"'"'C:\\Users\\gitte\\AppData\\Local\\Temp\\pip-install-kmbt5h2t\\rtree\\setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' egg_info --egg-base pip-egg-info
         cwd: C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\
    Complete output (11 lines):
    Traceback (most recent call last):
      File "<string>", line 1, in <module>
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\setup.py", line 3, in <module>
        import rtree
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\rtree\__init__.py", line 1, in <module>
        from .index import Rtree
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\rtree\index.py", line 6, in <module>
        from . import core
      File "C:\Users\gitte\AppData\Local\Temp\pip-install-kmbt5h2t\rtree\rtree\core.py", line 128, in <module>
        raise OSError("could not find or load %s" % lib_name)
    OSError: could not find or load spatialindex_c-64.dll
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

Пожалуйста, посоветуйте, что я могу сделать. Пока Spyder прекрасно работает, я просто не хочу, чтобы у меня возникали проблемы. Спасибо!

Answer 1

Похоже, Rtree требует libspatialindex (https://libspatialindex.org), который не устанавливается автоматически. Кажется, некоторые разработчики знают об этой проблеме и работают над ее исправлением:

https://github.com/Toblerity/rtree/issues/146 https://github.com/Toblerity/rtree/issues/147

Answer 2

Пришел сюда с той же проблемой, я не использую conda и не могу установить libspatialindex с pipenv:

# macOS Mojave 10.14.5
# python 3.7.4 (via pyenv)

Error: Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /var/folders/r7/2sx1wsvx0gj5x43wkmymg61w0000gq/T/tmpn09357tzbuild/rtree/

Найдено решение - установить spatialindex через Homebrew:

brew install spatialindex

Тогда pipenv install rtree успешно и теперь geopandas работает гладко
Надеюсь, это поможет