Из того, что я могу увидеть из исходного кода, он состоит из двух разделов.
Код C ++, который создает 32-битные и 64-битные dll (которые уже присутствуют, скомпилированные в хранилище внутри раздела java) .
Код java, который использует этот 32/64 бит dll и который будет генерировать файл jar после компиляции.
Вы должны быть в состоянии скомпилировать и получить результирующий java файл .jar с использованием кода java в хранилище. Возможно, попробуйте открыть его с помощью Eclipse, поскольку в нем есть файлы .project и .classpath из проекта Eclipse, это может упростить его сборку, поскольку в нем нет поддержки maven или graddle.