Если вы хотите получить выходные данные всех скрытых слоев, вам нужно добавить output_hidden_states=True
kwarg в вашу конфигурацию.
Ваш код будет выглядеть примерно так:
from transformers import DistilBertModel, DistilBertConfig
config = DistilBertConfig.from_pretrained('distilbert-base-cased', output_hidden_states=True)
model = DistilBertModel.from_pretrained('distilbert-base-cased', config=config)
Скрытые слои будут доступны как bert_output[2]