BoofCV не работает с маркерами Aruco, по крайней мере. Это было в списке wi sh некоторое время, так как все необходимое для обработки маркеров Aruco есть, но оно не поддерживает их словари.
https://boofcv.org/index.php?title=Tutorial_Fiducials
Инструкция по созданию маркеров BoofCV есть. В основном вы можете использовать инструмент командной строки для создания PDF-файлов. Может даже быть GUI, я не помню, но это не сложно.