Сообщения Linter, сгенерированные в терминале инструментами компиляции и компиляторами, полностью отделены от линтинга в реальном времени, генерируемого расширениями и показанного на панели проблем кода VS.
Последний исчезнет автоматически после исправления, но первый изменится только после того, как вы перестроите или перекомпилируете.