Если вы посмотрите на этот вывод, вы увидите, что «configure» не может найти некоторые заголовки:
checking for ANSI C header files... no
checking for sys/types.h... no
checking for sys/stat.h... no
checking for stdlib.h... no
checking for string.h... no
checking for memory.h... no
И в моей системе у меня есть этот заголовочный файл. Итак, я подозреваю, что на этом шаге вам нужна система, чтобы найти эти заголовки, чтобы иметь возможность компилировать "g cc"
ls -l /usr/include/stdlib.h
-rw-r--r--. 1 root root 34030 Aug 7 2019 /usr/include/stdlib.h
Похоже, вы пытались сказать "настроить", что ваш там находится заголовок:
--with-native-system-header-dir=/tools/include
Пожалуйста, дважды проверьте configure.log, если компилятор использовал правильное «-I», и этот заголовок существует.