Нельзя сохранить после закрытия приложения (остановки, выхода), но вы можете сделать следующее: вы можете прослушать событие закрытия в электронном приложении и использовать его для сохранения данных при пользователь закрывает приложение. Просто внедрите слушатель, который запускает ваш метод store.
Пример:
browserWindow.on("close", evt => {
// save-logic here
});