Изменение скорости нажатия клавиш обрабатывается на уровне сервера Xorg. Команда xset - это то, что вы ищете.
Опция r контролирует автоповтор. Вызов с помощью -r или r off отключит автоповтор, а r или r on - автоповтор. Если сервер поддерживает расширение XFree86-Mis c или расширение XKB (что он и делает), то принимается параметр rate, за которым должны следовать ноль, одно или два числа c. Первый указывает задержку перед запуском автоповтора, а второй - частоту повторения.
Например, эта команда запускается при каждом входе в систему (в .xinitrc):
xset r rate 300 50
Увеличивает автоповтор при удерживании всех клавиш.