У меня есть некоторые проблемы с установкой FEniCS (ОШИБКА conda.core.link:_execute(502)) - PullRequest
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/ 01 мая 2020

Я попытался установить программное обеспечение fenics с conda в mi notebook, но у меня возникла эта проблема в конце установки (у меня есть windows базы и виртуальной консоли Ubuntu). Я попытался переустановить, чтобы посмотреть на папки для отсутствующей папки или чего-то еще, но я застрял

Я покажу свою виртуальную консоль:

juan@DESKTOP-94MIG: ~ $ conda create -n fenicsproject - c conda-forge fenics Решение среды: выполнено

==> ВНИМАНИЕ: существует более новая версия conda. <== текущая версия: 4.5.11 последняя версия: 4.8.3 </p>

Пожалуйста, обновите conda, запустив

$ conda update -n base -c defaults conda

Пакетный план

расположение среды: / home / juan / anaconda3 / envs / fenicsproject

добавлены / обновлены спецификации: - fenics

Будут загружены следующие пакеты:

package                    |            build
---------------------------|-----------------
pkgconfig-1.4.0            |   py38h32f6830_0          11 KB  conda-forge
zlib-1.2.11                |    h516909a_1006         105 KB  conda-forge
libopenblas-0.3.9          |       h5ec1e0e_0         7.8 MB  conda-forge
wheel-0.34.2               |             py_1          24 KB  conda-forge
hypre-2.18.2               |       hc98498a_1         1.7 MB  conda-forge
eigen-3.3.7                |    hc9558a2_1001         966 KB  conda-forge
tk-8.6.10                  |       hed695b0_0         3.2 MB  conda-forge
petsc4py-3.12.0            |   py38h30bdb2a_4         1.3 MB  conda-forge
ptscotch-6.0.8             |       he9f2703_1         1.5 MB  conda-forge
fenics-dijitso-2019.1.0    |             py_9          41 KB  conda-forge
gcc_impl_linux-64-7.3.0    |       hd420e75_5        70.6 MB  conda-forge
libssh2-1.8.2              |       h22169c7_2         257 KB  conda-forge
gxx_linux-64-7.3.0         |      h553295d_18          21 KB  conda-forge
libedit-3.1.20170329       |    hf8c457e_1001         172 KB  conda-forge
sympy-1.5.1                |   py38h32f6830_3        10.3 MB  conda-forge
ca-certificates-2020.4.5.1 |       hecc5488_0         146 KB  conda-forge
boost-cpp-1.72.0           |       h8e57a91_0        21.8 MB  conda-forge
pip-20.1                   |     pyh9f0ad1d_0         1.1 MB  conda-forge
rhash-1.3.6                |    h14c3975_1001         141 KB  conda-forge
mpi4py-3.0.3               |   py38h4a80816_1         668 KB  conda-forge
fenics-libdolfin-2019.1.0  |       h24fb424_9        39.8 MB  conda-forge
icu-64.2                   |       he1b5a44_1        12.6 MB  conda-forge
metis-5.1.0                |    he1b5a44_1005         4.1 MB  conda-forge
fenics-dolfin-2019.1.0     |   py38ha98eaef_9         1.0 MB  conda-forge
binutils_impl_linux-64-2.34|       h53a641e_0         9.2 MB  conda-forge
suitesparse-5.6.0          |       h717dc36_0         2.4 MB  conda-forge
setuptools-46.1.3          |   py38h32f6830_0         635 KB  conda-forge
readline-8.0               |       hf8c457e_0         441 KB  conda-forge
liblapack-3.8.0            |      16_openblas          10 KB  conda-forge
fenics-fiat-2019.1.0       |             py_9          75 KB  conda-forge
libuv-1.34.0               |       h516909a_0         922 KB  conda-forge
sqlite-3.30.1              |       hcee41ef_0         2.0 MB  conda-forge
libffi-3.2.1               |    he1b5a44_1007          47 KB  conda-forge
pybind11-2.4.3             |   py38hbf85e49_3         123 KB  conda-forge
slepc4py-3.12.0            |   py38hb2ee469_1         306 KB  conda-forge
libblas-3.8.0              |      16_openblas          10 KB  conda-forge
superlu_dist-6.2.0         |       h5e15a89_2         900 KB  conda-forge
_libgcc_mutex-0.1          |      conda_forge           3 KB  conda-forge
slepc-3.12.2               |       h76dbdef_0         3.7 MB  conda-forge
mpi-1.0                    |            mpich           4 KB  conda-forge
gmpy2-2.1.0b1              |   py38h04dde30_0         212 KB  conda-forge
fenics-ufl-2019.1.0        |             py_9         166 KB  conda-forge
bzip2-1.0.8                |       h516909a_2         396 KB  conda-forge
xz-5.2.5                   |       h516909a_0         430 KB  conda-forge
libgcc-ng-9.2.0            |       h24d8f2e_2         8.2 MB  conda-forge
llvm-openmp-10.0.0         |       hc9558a2_0         2.8 MB  conda-forge
petsc-3.12.4               |       h432f2ec_0         9.7 MB  conda-forge
libgomp-9.2.0              |       h24d8f2e_2         816 KB  conda-forge
scalapack-2.0.2            |    hfacbc1e_1008         2.2 MB  conda-forge
cmake-3.17.0               |       h28c56e5_0        12.3 MB  conda-forge
six-1.14.0                 |             py_1          13 KB  conda-forge
fenics-2019.1.0            |           py38_9           9 KB  conda-forge
tbb-2020.1                 |       hc9558a2_0         1.4 MB  conda-forge
fenics-ffc-2019.1.0        |             py_9         248 KB  conda-forge
_openmp_mutex-4.5          |           1_llvm           5 KB  conda-forge
scotch-6.0.8               |       h0eec0ba_1         1.4 MB  conda-forge
libcurl-7.69.1             |       hf7181ac_0         573 KB  conda-forge
libstdcxx-ng-9.2.0         |       hdf63c60_2         4.5 MB  conda-forge
mpfr-4.0.2                 |       he80fd80_1         648 KB  conda-forge
gxx_impl_linux-64-7.3.0    |       hdf63c60_5        19.1 MB  conda-forge
binutils_linux-64-2.34     |      hc952b39_18          21 KB  conda-forge
mpc-1.1.0                  |    h04dde30_1007         151 KB  conda-forge
krb5-1.17.1                |       h2fd8d38_0         1.5 MB  conda-forge
ld_impl_linux-64-2.34      |       h53a641e_0         616 KB  conda-forge
mpich-3.3.2                |       hc856adb_0         6.4 MB  conda-forge
libcblas-3.8.0             |      16_openblas          10 KB  conda-forge
superlu-5.2.1              |    hfe2efc7_1207         172 KB  conda-forge
libgfortran-ng-7.3.0       |       hdf63c60_5         1.7 MB  conda-forge
mumps-mpi-5.2.1            |       h645f208_6         3.4 MB  conda-forge
python-3.8.2               |he5300dc_7_cpython        70.8 MB  conda-forge
certifi-2020.4.5.1         |   py38h32f6830_0         151 KB  conda-forge
gcc_linux-64-7.3.0         |      h553295d_18          22 KB  conda-forge
ncurses-6.1                |    hf484d3e_1002         1.3 MB  conda-forge
numpy-1.18.1               |   py38h8854b6b_1         5.3 MB  conda-forge
pkg-config-0.29.2          |    h516909a_1006         122 KB  conda-forge
hdf5-1.10.5                |mpi_mpich_ha7d0aea_1004         3.3 MB  conda-forge
gmp-6.2.0                  |       he1b5a44_2         811 KB  conda-forge
fastcache-1.1.0            |   py38h1e0a361_1          29 KB  conda-forge
mpmath-1.1.0               |             py_0         432 KB  conda-forge
parmetis-4.0.3             |    h9f7b9cf_1005         290 KB  conda-forge
mumps-include-5.2.1        |                6          23 KB  conda-forge
openssl-1.1.1g             |       h516909a_0         2.1 MB  conda-forge
python_abi-3.8             |           1_cp38           4 KB  conda-forge
expat-2.2.9                |       he1b5a44_2         191 KB  conda-forge
------------------------------------------------------------
                                       Total:       363.7 MB

УСТАНОВЛЕНЫ следующие НОВЫЕ пакеты:

_libgcc_mutex:          0.1-conda_forge                conda-forge
_openmp_mutex:          4.5-1_llvm                     conda-forge
binutils_impl_linux-64: 2.34-h53a641e_0                conda-forge
binutils_linux-64:      2.34-hc952b39_18               conda-forge
boost-cpp:              1.72.0-h8e57a91_0              conda-forge
bzip2:                  1.0.8-h516909a_2               conda-forge
ca-certificates:        2020.4.5.1-hecc5488_0          conda-forge
certifi:                2020.4.5.1-py38h32f6830_0      conda-forge
cmake:                  3.17.0-h28c56e5_0              conda-forge
eigen:                  3.3.7-hc9558a2_1001            conda-forge
expat:                  2.2.9-he1b5a44_2               conda-forge
fastcache:              1.1.0-py38h1e0a361_1           conda-forge
fenics:                 2019.1.0-py38_9                conda-forge
fenics-dijitso:         2019.1.0-py_9                  conda-forge
fenics-dolfin:          2019.1.0-py38ha98eaef_9        conda-forge
fenics-ffc:             2019.1.0-py_9                  conda-forge
fenics-fiat:            2019.1.0-py_9                  conda-forge
fenics-libdolfin:       2019.1.0-h24fb424_9            conda-forge
fenics-ufl:             2019.1.0-py_9                  conda-forge
gcc_impl_linux-64:      7.3.0-hd420e75_5               conda-forge
gcc_linux-64:           7.3.0-h553295d_18              conda-forge
gmp:                    6.2.0-he1b5a44_2               conda-forge
gmpy2:                  2.1.0b1-py38h04dde30_0         conda-forge
gxx_impl_linux-64:      7.3.0-hdf63c60_5               conda-forge
gxx_linux-64:           7.3.0-h553295d_18              conda-forge
hdf5:                   1.10.5-mpi_mpich_ha7d0aea_1004 conda-forge
hypre:                  2.18.2-hc98498a_1              conda-forge
icu:                    64.2-he1b5a44_1                conda-forge
krb5:                   1.17.1-h2fd8d38_0              conda-forge
ld_impl_linux-64:       2.34-h53a641e_0                conda-forge
libblas:                3.8.0-16_openblas              conda-forge
libcblas:               3.8.0-16_openblas              conda-forge
libcurl:                7.69.1-hf7181ac_0              conda-forge
libedit:                3.1.20170329-hf8c457e_1001     conda-forge
libffi:                 3.2.1-he1b5a44_1007            conda-forge
libgcc-ng:              9.2.0-h24d8f2e_2               conda-forge
libgfortran-ng:         7.3.0-hdf63c60_5               conda-forge
libgomp:                9.2.0-h24d8f2e_2               conda-forge
liblapack:              3.8.0-16_openblas              conda-forge
libopenblas:            0.3.9-h5ec1e0e_0               conda-forge
libssh2:                1.8.2-h22169c7_2               conda-forge
libstdcxx-ng:           9.2.0-hdf63c60_2               conda-forge
libuv:                  1.34.0-h516909a_0              conda-forge
llvm-openmp:            10.0.0-hc9558a2_0              conda-forge
metis:                  5.1.0-he1b5a44_1005            conda-forge
mpc:                    1.1.0-h04dde30_1007            conda-forge
mpfr:                   4.0.2-he80fd80_1               conda-forge
mpi:                    1.0-mpich                      conda-forge
mpi4py:                 3.0.3-py38h4a80816_1           conda-forge
mpich:                  3.3.2-hc856adb_0               conda-forge
mpmath:                 1.1.0-py_0                     conda-forge
mumps-include:          5.2.1-6                        conda-forge
mumps-mpi:              5.2.1-h645f208_6               conda-forge
ncurses:                6.1-hf484d3e_1002              conda-forge
numpy:                  1.18.1-py38h8854b6b_1          conda-forge
openssl:                1.1.1g-h516909a_0              conda-forge
parmetis:               4.0.3-h9f7b9cf_1005            conda-forge
petsc:                  3.12.4-h432f2ec_0              conda-forge
petsc4py:               3.12.0-py38h30bdb2a_4          conda-forge
pip:                    20.1-pyh9f0ad1d_0              conda-forge
pkg-config:             0.29.2-h516909a_1006           conda-forge
pkgconfig:              1.4.0-py38h32f6830_0           conda-forge
ptscotch:               6.0.8-he9f2703_1               conda-forge
pybind11:               2.4.3-py38hbf85e49_3           conda-forge
python:                 3.8.2-he5300dc_7_cpython       conda-forge
python_abi:             3.8-1_cp38                     conda-forge
readline:               8.0-hf8c457e_0                 conda-forge
rhash:                  1.3.6-h14c3975_1001            conda-forge
scalapack:              2.0.2-hfacbc1e_1008            conda-forge
scotch:                 6.0.8-h0eec0ba_1               conda-forge
setuptools:             46.1.3-py38h32f6830_0          conda-forge
six:                    1.14.0-py_1                    conda-forge
slepc:                  3.12.2-h76dbdef_0              conda-forge
slepc4py:               3.12.0-py38hb2ee469_1          conda-forge
sqlite:                 3.30.1-hcee41ef_0              conda-forge
suitesparse:            5.6.0-h717dc36_0               conda-forge
superlu:                5.2.1-hfe2efc7_1207            conda-forge
superlu_dist:           6.2.0-h5e15a89_2               conda-forge
sympy:                  1.5.1-py38h32f6830_3           conda-forge
tbb:                    2020.1-hc9558a2_0              conda-forge
tk:                     8.6.10-hed695b0_0              conda-forge
wheel:                  0.34.2-py_1                    conda-forge
xz:                     5.2.5-h516909a_0               conda-forge
zlib:                   1.2.11-h516909a_1006           conda-forge

Продолжить ([y] / n)? y

Загрузка и распаковка пакетов pkgconfig-1.4.0 | 11 кб | ################################################## ########################### | 100% zlib-1.2.11 | 105 кб | ################################################## ########################### | 100% либопенблас-0,3,9 | 7,8 МБ | ################################################## ########################### | 100% колесо-0.34.2 | 24 кб | ################################################## ########################### | 100% Hypre-2.18.2 | 1,7 МБ | ################################################## ########################### | 100% собственный-3.3.7 | 966 КБ | ################################################## ########################### | 100% ТК-8.6.10 | 3,2 МБ | ################################################## ########################### | 100% petsc4py-3.12.0 | 1,3 МБ | ################################################## ########################### | 100% ptscotch-6.0.8 | 1,5 МБ | ################################################## ########################### | 100% феникс-джиитсо-2019. | 41 кб | ################################################## ########################### | 100% gcc_impl_ linux -64-7. | 70,6 МБ | ################################################## ########################### | 100% libssh2-1.8.2 | 257 Кб | ################################################## ########################### | 100% gxx_ linux -64-7.3.0 | 21 Кб | ################################################## ########################### | 100% libedit-3.1.20170329 | 172 КБ | ################################################## ########################### | 100% симпй-1.5.1 | 10,3 МБ | ################################################## ########################### | 100% CA-сертификаты-2020 | 146 Кб | ################################################## ########################### | 100% повышение- cpp -1,72,0 | 21,8 МБ | ################################################## ########################### | 100% пип-20,1 | 1,1 МБ | ################################################## ########################### | 100% rha sh -1.3.6 | 141 Кб | ################################################## ########################### | 100% mpi4py-3.0.3 | 668 КБ | ################################################## ########################### | 100% феникс-либдольфин-201 | 39,8 МБ | ################################################## ########################### | 100% icu-64.2 | 12,6 МБ | ################################################## ########################### | 100% метис-5.1.0 | 4,1 МБ | ################################################## ########################### | 100% Феникс-Дольфин-2019.1 | 1,0 МБ | ################################################## ########################### | 100% binutils_impl_ linux - | 9,2 МБ | ################################################## ########################### | 100% suitesparse-5.6.0 | 2. 4 МБ | ################################################## ########################### | 100% setuptools-46.1.3 | 635 КБ | ################################################## ########################### | 100% readline-8.0 | 441 КБ | ################################################## ########################### | 100% liblapack-3.8.0 | 10 кб | ################################################## ########################### | 100% fenics-fiat-2019.1.0 | 75 кб | ################################################## ########################### | 100% libuv-1.34.0 | 922 КБ | ################################################## ########################### | 100% sqlite-3.30.1 | 2,0 МБ | ################################################## ########################### | 100% libffi-3.2.1 | 47 Кб | ################################################## ########################### | 100% pybind11-2.4.3 | 123 кб | ################################################## ########################### | 100% slepc4py-3.12.0 | 306 Кб | ################################################## ########################### | 100% libblas-3.8.0 | 10 кб | ################################################## ########################### | 100% superlu_dist-6.2.0 | 900 кб | ################################################## ########################### | 100% _libgcc_mutex-0.1 | 3 кб | ################################################## ########################### | 100% спит c -3.12.2 | 3,7 МБ | ################################################## ########################### | 100% mpi-1.0 | 4 кб | ################################################## ########################### | 100% gmpy2-2.1.0b1 | 212 КБ | ################################################## ########################### | 100% fenics-ufl-2019.1.0 | 166 КБ | ################################################## ########################### | 100% bzip2-1.0.8 | 396 КБ | ################################################## ########################### | 100% xz-5.2.5 | 430 КБ | ################################################## ########################### | 100% libg cc -ng-9.2.0 | 8,2 МБ | ################################################## ########################### | 100% llvm-openmp-10.0.0 | 2,8 МБ | ################################################## ########################### | 100% домашних животных c -3.12.4 | 9,7 МБ | ################################################## ########################### | 100% libgomp-9.2.0 | 816 Кб | ################################################## ########################### | 100% скальпак-2.0.2 | 2,2 МБ | ################################################## ########################### | 100% cmake-3.17.0 | 12,3 МБ | ################################################## ########################### | 100% шесть-1.14.0 | 13 Кб | ################################################## ########################### | 100% феникс-2019.1.0 | 9 кб | ################################################## ########################### | 100% tbb-2020.1 | 1,4 МБ | ################################################## ########################### | 100% феникс-фф c -2019.1.0 | 248 Кб | ################################################## ########################### | 100% _openmp_mutex-4.5 | 5 кб | ################################################## ########################### | 100% скотч-6.0.8 | 1,4 МБ | ################################################## ########################### | 100% libcurl-7.69.1 | 573 КБ | ################################################## ########################### | 100% libstdcxx-ng-9.2.0 | 4,5 МБ | ################################################## ########################### | 100% mpfr-4.0. 2 | 648 КБ | ################################################## ########################### | 100% gxx_impl_ linux -64-7. | 19,1 МБ | ################################################## ########################### | 100% binutils_ linux -64-2. | 21 Кб | ################################################## ########################### | 100% т. Пл. c -1,1,0 | 151 Кб | ################################################## ########################### | 100% krb5-1.17.1 | 1,5 МБ | ################################################## ########################### | 100% ld_impl_ linux -64-2.3 | 616 КБ | ################################################## ########################### | 100% mpich-3.3.2 | 6,4 МБ | ################################################## ########################### | 100% libcblas-3.8.0 | 10 кб | ################################################## ########################### | 100% суперлу 5.2.1 | 172 КБ | ################################################## ########################### | 100% libgfortran-ng-7.3.0 | 1,7 МБ | ################################################## ########################### | 100% паротит-mpi-5.2.1 | 3,4 МБ | ################################################## ########################### | 100% python -3.8.2 | 70,8 МБ | ################################################## ########################### | 100% сертификат-2020.4.5.1 | 151 Кб | ################################################## ########################### | 100% gcc_ linux -64-7.3.0 | 22 кб | ################################################## ########################### | 100% ncurses-6.1 | 1,3 МБ | ################################################## ########################### | 100% numpy -1.18.1 | 5,3 МБ | ################################################## ########################### | 100% pkg-config-0.29.2 | 122 кб | ################################################## ########################### | 100% hdf5-1.10.5 | 3,3 МБ | ################################################## ########################### | 100% gmp-6.2.0 | 811 Кб | ################################################## ########################### | 100% fastcache-1.1.0 | 29 кб | ################################################## ########################### | 100% mpmath-1.1.0 | 432 КБ | ################################################## ########################### | 100% парметис-4.0.3 | 290 Кб | ################################################## ########################### | 100% паротит-включить-5.2.1 | 23 кб | ################################################## ########################### | 100% openssl-1.1.1g | 2,1 МБ | ################################################## ########################### | 100% python_abi-3.8 | 4 кб | ################################################## ########################### | 100% экспатриант-2.2.9 | 191 Кб | ################################################## ########################### | 100% Подготовка транзакции: выполнено. Проверка транзакции: выполнено. Выполнение транзакции: сбой. ОШИБКА conda.core.link:_execute(502): Произошла ошибка при установке пакета 'conda-forge :: mpmath-1.1.0-py_0'. FileNotFoundError (2, "Нет такого файла или каталога: '/home/juan/anaconda3/envs/fenicsproject/bin/python3.8'") Попытка выполнить откат.

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