Rmarkdown не смог сгенерировать github_document с латексом (Ошибка 67) - PullRequest
1 голос
/ 13 апреля 2020

Я пытался связать несколько файлов Rmarkdown, которые выводят документ github_document, например:

---
title: 'TEST'
output:   
  github_document:
    pandoc_args: --webtex
always_allow_html: yes
---

\newcommand*{\indep}{\perp \!\!\! \perp}

$$\Bigl \{ Y_i, \; M_i \Bigr \} \indep{} \, A_i|Z_i=z $$

Полученная ошибка:

pandoc: Could not fetch https://latex.codecogs.com/png.latex?%5CBigl%20%5C%7B%20Y_i%2C%20%5C%3B%20M_i%20%5CBigr%20%5C%7D%20%7B%5Cperp%20%5C%21%5C%21%5C%21%20%5Cperp%7D%7B%7D%20%5C%2C%20A_i%7CZ_i%3Dz%20
FailedConnectionException2 "latex.codecogs.com" 443 True sendBuf: resource vanished (Broken pipe)
Error: pandoc document conversion failed with error 67
Execution halted

Недавняя запись столкнулся с аналогичной проблемой для github_document, но это не точный код ошибки, и предоставленное решение не возвращает весь латексный код в моем более длинном документе и не возвращает надлежащую независимую функцию. Например:

---
title: 'TEST'
output:   
  github_document:
    pandoc_args: --webtex=http://chart.apis.google.com/chart?cht=tx&chl=
always_allow_html: yes
---

\newcommand*{\indep}{\perp \!\!\! \perp}

$$\Bigl \{ Y_i, \; M_i \Bigr \} \indep{} \, A_i|Z_i=z $$

возвращает это изображение: новое независимое создание знака ранее, мой документ github мог создать это изображение (используя pandoc_args: --webtex): старый независимый генерация знака . По сути, это та же строка, за исключением нескольких вещей, так как она сделана на скриншоте, и тестовый файл был отредактирован для простоты.

В прошлом месяце все файлы смогли вернуть весь латексный код в моем длинном документе без проблем.

Некоторая дополнительная информация, которая может оказаться полезной:

─ Session info ─────────────────────────────────────────────────────────────────────
 setting  value                       
 version  R version 3.6.0 (2019-04-26)
 os       OS X El Capitan 10.11.6     
 system   x86_64, darwin15.6.0        
 ui       RStudio                     
 language (EN)                        
 collate  en_US.UTF-8                 
 ctype    en_US.UTF-8                 
 tz       America/New_York            
 date     2020-04-13                  

─ Packages ─────────────────────────────────────────────────────────────────────────
 ! package     * version date       lib source        
   assertthat    0.2.1   2019-03-21 [1] CRAN (R 3.6.0)
   base        * 3.6.0   2019-04-26 [?] local         
   cli           1.1.0   2019-03-19 [1] CRAN (R 3.6.0)
 P compiler      3.6.0   2019-04-26 [1] local         
   crayon        1.3.4   2017-09-16 [1] CRAN (R 3.6.0)
 P datasets    * 3.6.0   2019-04-26 [1] local         
   digest        0.6.19  2019-05-20 [1] CRAN (R 3.6.0)
   evaluate      0.14    2019-05-28 [1] CRAN (R 3.6.0)
 P graphics    * 3.6.0   2019-04-26 [1] local         
 P grDevices   * 3.6.0   2019-04-26 [1] local         
 P grid          3.6.0   2019-04-26 [1] local         
   gridExtra     2.3     2017-09-09 [1] CRAN (R 3.6.0)
   gtable        0.3.0   2019-03-25 [1] CRAN (R 3.6.0)
   htmltools     0.4.0   2019-10-04 [1] CRAN (R 3.6.0)
   knitr         1.24    2019-08-08 [1] CRAN (R 3.6.0)
 P methods     * 3.6.0   2019-04-26 [1] local         
   Rcpp          1.0.1   2019-03-17 [1] CRAN (R 3.6.0)
   rlang         0.4.0   2019-06-25 [1] CRAN (R 3.6.0)
   rmarkdown     1.15    2019-08-21 [1] CRAN (R 3.6.0)
   rsconnect     0.8.15  2019-07-22 [1] CRAN (R 3.6.0)
   rstudioapi    0.10    2019-03-19 [1] CRAN (R 3.6.0)
   sessioninfo   1.1.1   2018-11-05 [1] CRAN (R 3.6.0)
 P stats       * 3.6.0   2019-04-26 [1] local         
 P tools         3.6.0   2019-04-26 [1] local         
 P utils       * 3.6.0   2019-04-26 [1] local         
   withr         2.1.2   2018-03-15 [1] CRAN (R 3.6.0)
   xfun          0.9     2019-08-21 [1] CRAN (R 3.6.0)
   yaml          2.2.0   2018-07-25 [1] CRAN (R 3.6.0)

[1] /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library

P ── Loaded and on-disk path mismatch.
> rmarkdown::pandoc_version()
[1] ‘1.19.2.1’

Из-за моей ОС я не могу обновить систему до последней версии * pando c или RStudio.

1 Ответ

0 голосов
/ 06 мая 2020

РЕШЕНИЕ, обеспечиваемое поддержкой codecogs!

---
title: 'TEST'
output:   
  github_document:
    pandoc_args: --webtex=https://ibm.codecogs.com/png.latex?
always_allow_html: yes
---

\newcommand*{\indep}{\perp \!\!\! \perp}

$$\Bigl \{ Y_i, \; M_i \Bigr \} \indep{} \, A_i|Z_i=z $$

По словам группы поддержки в codecogs, они находились в процессе перехода кеша уравнений, поэтому на их сайте возникло много неожиданных проблем. Так что для меня мой код будет выполняться, возможно, менее чем в 5% случаев, а для других людей, которые запускали мой код и говорили, что он работает, они могли это сделать, потому что сайт, вероятно, был «запущен» в то время , В настоящее время они работают над решением многих проблем, и, к счастью, я смог получить помощь в их решении этой проблемы.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...