Предупреждающие сообщения glmer - PullRequest
0 голосов
/ 25 февраля 2020

Я пытаюсь подобрать следующий блеск: разложение (пропорция) помета в зависимости от ковариат. Фиксированными ковариатами являются тип чая (категориальный с двумя уровнями), микробитат (категориальный с тремя уровнями), MAP (непрерывный) и MAT (непрерывный). Термины взаимодействия представляют собой MAT x MAP, MAT x microhabitat и MAP x microhabitat. Мы используем график, вложенный в сайт как случайный эффект, чтобы учесть зависимость наблюдений на графиках внутри сайтов.

MAP1 <-MAP / 100 </p>

M2<-glmer(Fraction_decomposed~MAT*MAP1*Treatment+Tea+(1|Site/Plot),family = binomial(link = "logit"))

Но я получил следующие предупреждающие сообщения:

Warning messages:
1: In eval(family$initialize, rho) :
  non-integer #successes in a binomial glm!
2: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv,  :
  unable to evaluate scaled gradient
3: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv,  :
  Model failed to converge: degenerate  Hessian with 1 negative eigenvalues

введите описание изображения здесь

Я также попытался преобразовать переменную ответа и выполнил lmer, но я прочитал, что преобразования не рекомендуется

Fraction_decomposed1 <-lo git (Fraction_decomposed) </p>

M3 <-lmer (Fraction_decomposed1 ~ MAT * MAP1 * Лечение + Чай + (1 | Участок / Участок)) isSingular (M3) Резюме Anova (M3) (M3) </p>

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...