Вы анализируете время в ложном измерении. Ваша таблица должна выглядеть так:
<tr>
<th>Bust Stop 1</th>
<th>Bust Stop 2</th>
</tr>
<tr>
<td>Bus Stop 1 time 1</td>
<td>Bus Stop 2 time 1</td>
</tr>
<tr>
<td>Bus Stop 1 time 2</td>
<td>Bus Stop 2 time 2</td>
</tr>
...
В настоящее время она выглядит примерно так:
<tr>
<th>Bust Stop 1</th>
<td>Bust Stop 1 time 1</td>
</tr>
<tr>
<th>Bust Stop 1</th>
<td>Bust Stop 1 time 2</td>
</tr>
<tr>
<th>Bust Stop 1</th>
<td>Bust Stop 1 time 3</td>
</tr>
<tr>
<th>Bust Stop 2</th>
<td>Bust Stop 2 time 1</td>
</tr>
<tr>
<th>Bust Stop 2</th>
<td>Bust Stop 2 time 2</td>
</tr>
<tr>
<th>Bust Stop 2</th>
<td>Bust Stop 2 time 3</td>
</tr>
Также я рекомендую использовать функцию PHP date правильно отформатировать время.