SRA BioQuery присоединиться запрос - PullRequest
0 голосов
/ 02 мая 2020

Невозможно получить результат для следующего queryID:

api-project-54985843899: US.bquxjob_65c4241e_171d31657bb

Запрос:

SELECT 
    tax.acc, tax.tax_id, tax.rank, tax.name, tax.total_count, 
    tax.self_count, tax.ilevel, tax.ileft, tax.iright
FROM nih-sra-datastore.sra.metadata as m, 
     nih-sra-datastore.sra_tax_analysis_tool.tax_analysis as tax 
WHERE m.acc=tax.acc 
      and m.organism = 'human metagenome' 
      OR m.organism = 'gut metagenome' 
      OR m.organism = 'human gut metagenome'

Как анализ метаданных и таксономии таблица огромна, для присоединения требуется много времени.

Возможно ли получить файл с разделителями табуляции для вышеуказанного запроса?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...