Я пытаюсь загрузить пакет "Seurat" в R, пакет установлен, и теперь он находится в моем списке пакетов.
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (patchwork)
The downloaded source packages are in
‘C:\Users\parnian\AppData\Local\Temp\RtmpAVgSd8\downloaded_packages’
Но когда я пытаюсь вызвать его (библиотека (Seurat )) Я получаю следующую ошибку:
> library(Seurat)
Error: package or namespace load failed for ‘Seurat’:
object ‘wrap_plots’ is not exported by 'namespace:patchwork'
Я читаю подобные вопросы и устанавливаю вручную "лоскутное одеяло":
> install.packages("patchwork")
WARNING: Rtools is required to build R packages but is not currently installed. Please download and install the appropriate version of Rtools before proceeding:
https://cran.rstudio.com/bin/windows/Rtools/
Installing package into ‘C:/Users/parnian/Documents/R/win-library/4.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
R также говорит мне установить Rtools, который у меня есть, но когда я выполняю следующие команды:
> writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")
, но когда я хочу убедиться, что make может быть найден (Sys.which("make")), я получаю это:
> Sys.which("make")
make
""
Также мой загруженный пакеты сохраняются в месте, которое даже не существует на моем компьютере! Как я могу это исправить?
Спасибо