Visual Studio 2008 имеет улучшенную поддержку Javascript. Вы можете отлаживать его, как обычный код C #, хотя иногда он все еще глючит (например, он не хочет устанавливать точку останова в первой строке функции, например, вложенные функции также затрудняют это).
Также есть поддержка Intellisense, но она работает так себе. Многое зависит от того, какую среду JS вы собираетесь использовать.
В общем, VS, безусловно, не лучшая среда разработки для JS, но, возможно, лучший компромисс, если вы уже знакомы с ней и в любом случае разрабатываете для .NET.