Я использую пакет pRO C для вычисления доверительных интервалов для лучших значений, связанных с точками (индекс Youdens).
Начальные медианы (кроме чувствительности) значений, как правило, немного выше, чем отдельные значения, которые я получаю за лучшую точку.
Что может быть причиной этого и может ли это означать, что нижний и верхний пределы доверительных интервалов также могут быть искажены в антиконсервативном направлении?
Спасибо
Мой код:
coords(rocObj, x="best", input="threshold", best.method="youden",ret=c("sensitivity","specificity","ppv","npv","threshold"),transpose = TRUE)
Output:
sensitivity specificity ppv npv threshold
0.8913043 0.8387097 0.9318182 0.7572816 0.6614354
ci.coords(rocObj,x="best",input = "threshold",ret=c("sensitivity","specificity","ppv","npv"))
Output:
95% CI (2000 stratified bootstrap replicates):
threshold sensitivity.low sensitivity.median sensitivity.high specificity.low specificity.median
best best 0.7477 0.8913 0.9522 0.7634 0.8602
specificity.high ppv.low
0.9677 0.9067
pv.median ppv.high npv.low npv.median npv.high
best 0.9404 0.9824 0.6014 0.7615 0.8706