Ну, разница в управлении памятью , поэтому Intellij (при запуске) резервирует достаточно кучи памяти для решения будущих сложных задач (для программирования: редактирование кода, компиляция, ...), поэтому задача открытие больших файлов проще, чем в notpad, который создан для выполнения простых задач быстрое редактирование небольших текстов .