Это не то, что вы должны настраивать в распределенном файле конфигурации (".htaccess"), это не то, для чего эти файлы предназначены. Вместо этого это должно быть реализовано на отдельном виртуальном хосте, где вам вообще не нужно условие.
A RewriteCond
является частью модуля перезаписи, вы не можете каким-то образом использовать его в сочетании с директивами других модулей.
Вы можете попробовать что-то подобное, но, как уже было сказано, я бы не советовал этого:
<If "%{HTTP_HOST} == 'dev.example.com'">
AddHandler fcgid-script .php
MultiviewsMatch Handlers Filters
</If>
Здесь вы можете найти документацию: https://httpd.apache.org/docs/2.4/expr.html#examples