Чтобы получить экземпляр в автозагрузке, вы можете использовать следующий код:
//1.Register the service
services.AddDbContext<MyDbContext>(options =>
options.UseSqlServer(Configuration.GetConnectionString("YourConnnectionString")));
//2.Build an intermediate service provider
var sp = services.BuildServiceProvider();
//3.Resolve the services from the service provider
var myDbContext = sp.GetService<MyDbContext>();
//4.then you could pass the myDbContext to the EventBusExtension.GetHandlers()