Вы можете просто узнать количество страниц вот так:
var pageCount = myDocument.pages.length
$.writeln("The document has " + pageCount + " pages.");
Btw. сценарий InDesign выполняется на JavaScript (или, точнее, на ExtendScript, который является диалектом JavaScript), который сильно отличается от Java.
Изменить: Хорошо, отвечая на ваш комментарий , Я понятия не имею, что такое InDesignServerAPI.jar, но, глядя на ваш код, похоже, что язык InDesign ExtendScript просто как бы заключен в код Java. Я предполагаю, что вы можете получить количество страниц следующим образом:
int pageCount = myDocument.pages.length;