Возможно, ваша папка содержит только файлы, которые игнорируются вашим .gitignore. Пустые папки не загружаются автоматически на github или heroku, если они не содержат «что-то». Попробуйте добавить простой файл .txt, зафиксируйте это изменение и посмотрите, работает ли оно.