Я бы порекомендовал вам использовать jQuery, так как он намного проще в использовании, чем обычный JavaScript.
Но если вы хотите добавить коды css в файл javascript, вы можете попробовать:
$("#id").css("param","prop");
Пример:
$("#id").css("color","red");
О ссылке на внешний файл CSS? Попробуйте @Mr. Решение Polywhirl.
Надеюсь, это поможет ..