Режим подключения предназначен для настройки IDE для использования того же набора правил, который настроен в вашем профиле качества на сервере SonarQube, поэтому, если правила запаха кода являются частью вашего профиля качества, они будут включены в IDE тоже.
Если вы не хотите, чтобы эти проблемы отображались в IDE, вы можете либо удалить эти правила из профиля качества, либо использовать автономный режим и настроить набор правил для локального запуска, как описано здесь .