Важная концепция для понимания: файловая система, в которой работает экземпляр EC2, пока он работает не является постоянной. Доступны инструменты / службы, которые позволяют монтировать файловые системы, поддерживаемые хранилищем S3, или вы можете загрузить на S3 или другую службу хранения из экземпляра, но когда экземпляр закрывается, соответствующая файловая система больше не существует.
Что касается инструментов, я считаю, что инструменты Amazon великолепны, но вам, вероятно, будет удобно работать с командной строкой, если вы идете по этому маршруту.