Я предполагаю, что вы использовали numpy.savetxt(), чтобы преобразовать массив numpy в текстовый файл.
Вы можете преобразовать файл в формат NPZ, используя numpy.savez()
Другой подход, если вы хотите загрузить файл .txt как массив, - это использовать numpy.loadtxt(), рекомендуется также использовать reshape, чтобы правильно определить строки и столбец массива.