Я думаю, что в файле 2 вы должны изменить
var tso1 = $('.assign-tags').selectize;
var tso = tso1[0].selectize;
на var tso = $('.assign-tags')[0].selectize;
, потому что то, что вы говорите, это
возьмите первый элемент массива $('.assign-tags').selectize
, а затем возьмите его "selectize" свойство
но я думаю, что вы имели в виду
возьмите первый элемент $('.assign-tags')
(ie $('.assign-tags')[0]
) и из него возьмите свойство "selectize"
, поэтому файл 2 должен стать чем-то вроде следующего кода
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function () {
var tso1 = $('.assign-tags')[0];
var tso = tso1.selectize;
tso.addOption({value:100, text: 'BBBBB'});
tso.refreshOptions();
tso.addItem(100);
});