Поговорил с одним из сопровождающих запуска c, Алексой Сарай, и он объяснил, почему это происходит.
По замыслу, среда выполнения golang порождает несколько потоков для управления процессом. run c записывается в golang, и при сборке / запуске в контейнер существует короткое время, когда процесс run c выполняется внутри контейнера (перед запуском запрошенного пользователем исполняемого файла , например, bash в docker exec bash). В Linux потоки и процессы идентифицируются с помощью идентификаторов из одного пула, поэтому потоки времени выполнения go подсчитываются в пространстве имен pid контейнера, что приводит к описанному мной скачку pid.