Ошибка в .jnew ("edu / uic / ncdm / venn / data / VennData", as.character (комбинации),: - PullRequest
0 голосов
/ 10 июля 2020

Некоторое время я использовал go, он работал нормально, не уверен, что сейчас не работает ..

Я использовал Venneuler для создания диаграммы Венна. Я читаю два фрейма данных: cosmic_ata c и cosmic_rna, которые имеют разную длину, затем объединяю их в один фрейм данных с помощью cbindPad, а затем запускаю venneuler. Не уверен, в чем заключается ошибка. Любая помощь или предложение будут действительно признательны.

Ошибка в .jnew ("edu / uic / ncdm / venn / data / VennData", as.character ( комбинации),: java .lang.NoSuchMethodError:

dput(cosmic_atac)
structure(list(gene = c("ENSG00000136754", "ENSG00000143322", 
"ENSG00000196914", "ENSG00000143437", "ENSG00000129993", "ENSG00000067955", 
"ENSG00000114423", "ENSG00000142273", "ENSG00000165556", "ENSG00000109220", 
"ENSG00000172409", "ENSG00000124795", "ENSG00000119772", "ENSG00000102034", 
"ENSG00000187239", "ENSG00000163655", "ENSG00000106031", "ENSG00000123364", 
"ENSG00000128713", "ENSG00000083168", "ENSG00000073614", "ENSG00000002834", 
"ENSG00000130675", "ENSG00000133392", "ENSG00000165671", "ENSG00000110713", 
"ENSG00000116132", "ENSG00000164985", "ENSG00000163902", "ENSG00000079102", 
"ENSG00000184702", "ENSG00000125354", "ENSG00000072501", "ENSG00000138336", 
"ENSG00000100815")), row.names = c(NA, -35L), class = c("tbl_df", 
"tbl", "data.frame"))


dput(cosmic_rna)
structure(list(gene = c("ENSG00000136754", "ENSG00000143322", 
"ENSG00000196914", "ENSG00000143437", "ENSG00000129993", "ENSG00000067955", 
"ENSG00000114423", "ENSG00000165556", "ENSG00000109220", "ENSG00000172409", 
"ENSG00000124795", "ENSG00000119772", "ENSG00000102034", "ENSG00000187239", 
"ENSG00000163655", "ENSG00000106031", "ENSG00000083168", "ENSG00000073614", 
"ENSG00000002834", "ENSG00000178053", "ENSG00000130675", "ENSG00000133392", 
"ENSG00000165671", "ENSG00000110713", "ENSG00000164985", "ENSG00000163902", 
"ENSG00000079102", "ENSG00000184702", "ENSG00000125354", "ENSG00000072501", 
"ENSG00000138336", "ENSG00000100815")), row.names = c(NA, -32L
), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"))

1 Ответ

1 голос
/ 10 июля 2020

Кажется, это сработает, если вы создадите dat таблицу данных и сделаете уникальные имена столбцов:

Created on 2020-07-09 by the

пакет реплекс (v0.3.0)
...