порядковая логистика c регрессия с БОЛЕЕ ОДНОГО случайных эффектов - PullRequest
0 голосов
/ 26 мая 2020

Я оцениваю, насколько метод B для сбора данных предсказывает метод A.

Важно СКАЗАТЬ, что МЕТОД A имеет данные ИЕРАРХИИ (по шкале от 0 до 3), а МЕТОД B имеет данные с НЕПРЕРЫВНЫМИ ЗНАЧЕНИЯМИ.

Кто-нибудь знает, как использовать более одной случайной величины в? Потому что я хотел бы сделать двойное вложение, используя в качестве случайной переменной как ландшафт, так и информатор.

Спасибо

data_model1<-read.csv("test2.csv",h=T,sep=";")
str(baseline) 
library(ordinal)
baseline$method_A=factor(baseline$method_A, levels=0:3, ordered = T)
mod = clmm(method_A~method_B*species+(1|landscape/Informant), data=baseline, Hess=T, nAGQ=17)
summary(mod)
Informant	laandscape	species	method_A	method_B
Namea	AA	Cheracebus_lucifer	2	0.000
Namea	AA	Cuniculus_paca	3	0.000
Namea	AA	Dasyprocta_fuliginosa	1	0.000
Namea	AA	Dasypus_novemcinctus	2	0.000
Namea	AA	Didelphis_marsupialis	3	0.000
Namea	AA	Eira_barbara	2	0.552
Namea	AA	Hydrochoerus_hydrochaeris	1	0.004
Namea	AA	Lagothrix_lagotricha	2	0.000
Namea	AA	Leontocebus_nigricollis	2	0.035
Namea	AA	Leopardus_pardalis	2	0.000
Namea	AA	Lontra_longicaudis	2	0.000
Nameb	AA	Cheracebus_lucifer	1	0.004
Nameb	AA	Cuniculus_paca	1	0.000
Nameb	AA	Dasyprocta_fuliginosa	3	0.313
Nameb	AA	Dasypus_novemcinctus	1	1.030
Nameb	AA	Didelphis_marsupialis	0	0.000
Nameb	AA	Eira_barbara	0	0.000
Nameb	AA	Hydrochoerus_hydrochaeris	0	0.000
Nameb	AA	Lagothrix_lagotricha	3	0.004
Nameb	AA	Leontocebus_nigricollis	3	0.000
Nameb	AA	Leopardus_pardalis	2	0.000
Nameb	AA	Lontra_longicaudis	2	0.000
Namec	AA	Cheracebus_lucifer	2	0.000
Namec	AA	Cuniculus_paca	1	0.000
Namec	AA	Dasyprocta_fuliginosa	1	0.552
Namec	AA	Dasypus_novemcinctus	1	0.004
Namec	AA	Didelphis_marsupialis	2	0.000
Namec	AA	Eira_barbara	2	0.035
Namec	AA	Hydrochoerus_hydrochaeris	2	0.000
Namec	AA	Lagothrix_lagotricha	3	0.000
Namec	AA	Leontocebus_nigricollis	3	0.004
Namec	AA	Leopardus_pardalis	0	0.000
Namec	AA	Lontra_longicaudis	0	0.313
Named	BB	Cheracebus_lucifer	0	1.030
Named	BB	Cuniculus_paca	0	0.000
Named	BB	Dasyprocta_fuliginosa	3	0.000
Named	BB	Dasypus_novemcinctus	3	0.000
Named	BB	Didelphis_marsupialis	2	0.004
Named	BB	Eira_barbara	2	0.000
Named	BB	Hydrochoerus_hydrochaeris	2	0.552
Named	BB	Lagothrix_lagotricha	0	0.004
Named	BB	Leontocebus_nigricollis	0	0.000
Namee	BB	Cheracebus_lucifer	0	0.035
Namee	BB	Cuniculus_paca	0	0.000
Namee	BB	Dasyprocta_fuliginosa	3	0.000
Namee	BB	Dasypus_novemcinctus	3	0.004
Namee	BB	Didelphis_marsupialis	2	0.000
Namee	BB	Eira_barbara	2	0.313
Namee	BB	Hydrochoerus_hydrochaeris	2	1.030
Namee	BB	Lagothrix_lagotricha	2	0.000
Namee	BB	Leontocebus_nigricollis	2	0.000
Namef	BB	Cheracebus_lucifer	2	0.000
Namef	BB	Cuniculus_paca	2	0.004
Namef	BB	Dasyprocta_fuliginosa	2	0.000
Namef	BB	Dasypus_novemcinctus	2	0.000
Namef	BB	Didelphis_marsupialis	1	0.000
Namef	BB	Eira_barbara	1	0.552
Namef	BB	Hydrochoerus_hydrochaeris	1	0.004
Namef	BB	Lagothrix_lagotricha	1	0.000
Namef	BB	Leontocebus_nigricollis	3	0.035
Nameg	CC	Cheracebus_lucifer	0	0.000
Nameg	CC	Cuniculus_paca	3	0.000
Nameg	CC	Dasyprocta_fuliginosa	3	0.004
Nameg	CC	Dasypus_novemcinctus	3	0.000
Nameg	CC	Didelphis_marsupialis	3	0.313
Nameg	CC	Eira_barbara	3	1.030
Nameg	CC	Hydrochoerus_hydrochaeris	3	0.000
Nameg	CC	Lagothrix_lagotricha	2	0.000
Nameg	CC	Leontocebus_nigricollis	2	0.000
Nameh	CC	Cheracebus_lucifer	2	0.004
Nameh	CC	Cuniculus_paca	2	0.000
Nameh	CC	Dasyprocta_fuliginosa	2	0.552
Nameh	CC	Dasypus_novemcinctus	2	0.004
Nameh	CC	Didelphis_marsupialis	2	0.000
Nameh	CC	Eira_barbara	2	0.035
Nameh	CC	Hydrochoerus_hydrochaeris	1	0.000
Nameh	CC	Lagothrix_lagotricha	1	0.000
Nameh	CC	Leontocebus_nigricollis	1	0.004
Namei	CC	Cheracebus_lucifer	1	0.000
Namei	CC	Cuniculus_paca	2	0.313
Namei	CC	Dasyprocta_fuliginosa	2	1.030
Namei	CC	Dasypus_novemcinctus	3	0.000
Namei	CC	Didelphis_marsupialis	3	0.000
Namei	CC	Eira_barbara	3	0.000
Namei	CC	Hydrochoerus_hydrochaeris	3	0.004
Namei	CC	Lagothrix_lagotricha	3	0.000
Namei	CC	Leontocebus_nigricollis	2	0.313
Namej	DD	Dasypus_novemcinctus	2	1.030
Namej	DD	Didelphis_marsupialis	2	0.000
Namej	DD	Eira_barbara	2	0.000
Namej	DD	Hydrochoerus_hydrochaeris	2	0.000
...