Нет настраиваемого ограничения, прежде всего потому, что CouchDB использует хранилище только для добавления, то есть оно обещает только когда-либо записывать в конец файла и никогда ничего не менять в середине. В результате настраиваемый предел не имеет смысла.
Уплотнение - ваш единственный выбор. Поговаривали об автоматически инициируемом уплотнении в списках рассылки, но пока его можно запускать только вручную.