Как описано в руководстве , псевдоним целевой таблицы должен быть указан в части UPDATE, а не FROM.
UPDATE changegroup cg
SET NEWSTRING = ''
FROM jiraissue i,
project p,
changeitem ci,
app_user au
WHERE cg.issueid = i.id
AND i.project = p.id
AND ci.groupid = cg.id AND ci.FIELD='Access Matrix Table'
AND cg.author = au.user_key
AND cg.issueid = (select id
from jiraissue
where issuenum = 124
and project in (select id
from project
where pname = 'NTW Customer Incident Management'))
Целевая таблица не может быть используется в условии JOIN, поэтому легче переместить все условия соединения в предложение WHERE.