Я работаю над данными RNAseq по эмбрионам лошадей. Я выполнил MFA, потому что я разрезал эмбрионы на 2 части и анализировал каждую часть отдельно. Я построил график по группе кобыл (YN, YM или OM) или полу эмбриона. Я пытаюсь выполнить "fviz_ellipses" из Factoextra, и у меня есть некоторые проблемы с его настройкой.
Я хотел бы иметь форму точки для каждого условия (всего 5), и я хотел бы добавить легенду. Вот мой последний скрипт:
fviz_ellipses(mfa,
habillage=c("group","sexe"),
pointshape=c(15,16,17, 0, 3),
geom="point",
addEllipses = TRUE,
ellipse.type = "confidence",
legend.title=c("Groupe", "Sexe"),
palette=c("#FF7C80", "#B2B2B2","#FFCC00", "#5BFF09", "#00A4F6"),
repel = TRUE)
, но pointshape не работал вообще, как legend.title. Вот моя цифра: введите описание изображения здесь
Я пробовал несколько вариантов, но так и не получил то, что хотел.