Factoextra: fviz_ellipses, добавление легенды и изменение формы точки в соответствии с группой - PullRequest
0 голосов
/ 03 августа 2020

Я работаю над данными RNAseq по эмбрионам лошадей. Я выполнил MFA, потому что я разрезал эмбрионы на 2 части и анализировал каждую часть отдельно. Я построил график по группе кобыл (YN, YM или OM) или полу эмбриона. Я пытаюсь выполнить "fviz_ellipses" из Factoextra, и у меня есть некоторые проблемы с его настройкой.

Я хотел бы иметь форму точки для каждого условия (всего 5), и я хотел бы добавить легенду. Вот мой последний скрипт:

fviz_ellipses(mfa,
              habillage=c("group","sexe"), 
              pointshape=c(15,16,17, 0, 3),
              geom="point",
              addEllipses = TRUE,
              ellipse.type = "confidence",
              legend.title=c("Groupe", "Sexe"),
              palette=c("#FF7C80", "#B2B2B2","#FFCC00", "#5BFF09", "#00A4F6"),
              repel = TRUE)

, но pointshape не работал вообще, как legend.title. Вот моя цифра: введите описание изображения здесь

Я пробовал несколько вариантов, но так и не получил то, что хотел.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...